太阳要求微软3500赔偿万美元的损失费，外加诉讼费和律师费。
为了证明太阳的观点，太阳在自己的网站上首次规定微软每年向太阳缴纳350万美元的使用费。
为期5年。
微软在长大335页的反诉讼状中，拒绝承认太阳的任何指控，并反诉违反合同，破坏合同中的平等原则和以诚相待的原则，以及进行不正当竞争。
微软说太阳没有实现它在1996年3月11日双方签署合同是做出的承诺。
1998年11月17日，联邦法院做出了一审判决，判决书说：本庭初步调查表明，微软明显地违背了它与太阳关于Java技术的合同。
如果最后表明这是事实的话，微软所使用的那些在太阳的Java语言定义中不存在的关键词和特殊编译原理就必须从微软以后的Java开发工具中去掉。
表面上看，太阳虽然赢得了这场战争。
但微软手中捏着一件武器，这就是与爪哇语言功能相似的ActiveX。
现在，微软和太阳在加紧研发和完善自己的项目，两者的竞争还远远没有结束。
2002年3月8日，太阳向加州圣何塞联邦地方法院呈交起诉书，控告微软违反反垄断法，并要求其支付损害赔偿。
太阳表示，其控告微软主要是因微软涉及反竞争性行为，同时因微软决定在其最新的WindowsXP操作系统中不支持太阳的Java软件。
太阳还要求微软公开并特许与IE等产品有关的电脑协议和格式。
太阳公司在其诉讼书中称：微软企图利用.Net互联网架构进一步巩固其在操作系统中的垄断地位，使得今后任何一种与互联网相连的设备的软件开发都属于微软的领地。
并称太阳此举试图阻止微软利用其在操作系统领域中的霸主地位继续从事垄断活动，要求微软不得将其.Net战略建立在Windows操作系统的基础之上。
对太阳公司的起诉，当时微软将这一问题称作是老调重弹，认为其中很多问题都在2001年的微软垄断案审理中得到了解决。
微软与司法部达成的和解协议将妥善地解决这一问题。
微软公司在2001年秋天首次推出视窗XP操作系统时曾将Java软件从IE浏览器中撤下，微软当时表示其担心将这种软件包括在IE当中有可能促使太阳通过司法手段阻止XP系统的面市。
分析人士指出，Java有可能对微软构成威胁，因为这种软件可以使程序编写人员设计一些专门服务于Java而非视窗系统的软件。
依据Motz在2002年12月23日裁决，太阳公司极有可能赢得对微软公司的反垄断诉讼，该裁决同时包括强迫微软公司在其Windows中支持Java语言的初步结论。
Motz要求争执双方各自拿出一个如何执行其裁决的具体细化的方案，然后再讨论出一个可行折中的方案。
但是双方却难以达成一致。
太阳公司在向法庭提交的文件中表示，微软公司试图减少和推迟履行其发行支持Java语言的平台的责任。
根据微软公司的计划，在Windows中能够支持Java将在一年之后实现。
太阳对此十分不满。
而微软公司则表示，太阳公司计划过于冒失，势必会损害行业和消费者的利益。
太阳的讼状中表示，微软正在试图破坏Java，并达到以其.NetWeb软件服务垄断市场的目的。
太阳的发言人认为微软将Java视做危险的东西，因为其不仅仅可以在Windows操作系统上运行。
早先，微软就迫使Java不能够很好的运行在Windows系统中，但在2002年，微软进一步宣布将Java摒弃在Windows XP操作系统之外。
微软公司的发言人Jim Desler表示，太阳公司关于将Java纳入Windows的提议是混乱且范围过大的，并且所要求的时间表极其不合理，如果执行这样的计划将给业界和消费者带来伤害。
微软公司提出了很长的反建议。
Jim Desler说，我们已经提出了明确的建议，将很快的完满执行法庭的裁决，并且不会带来太阳计划那样的负面效果。
太阳公司表示，微软公司的建议将为裁决的执行设置了过多的障碍在商业上是不合理的，并将使太阳蒙受更大的损失，微软公司建议中的一些条款将损害太阳的既得利益。
太阳公司还抱怨说，特别不合理的地方在于，微软的建议中准备只把Java作为建议升级的软件在其网站上提供，并以CD的形式提供给计算机制造厂商。
它要求法庭不要理睬微软的反建议，应当强制执行其作出的裁决。