到1808年末，人们几乎已普遍认为禁运失败了。
到1809年3月，杰斐逊作为总统所采取的最后行动之一，就是在离开白宫之前几天签署了撤销禁运法令的文件，承认了禁运失败，但仍然认为若不是走私猖獗，禁运本会奏效。
他后来还坚持说倘若禁运再坚持两个月，也许就不至于发生1812年的美英战争。
在停止禁运的当时，他担心禁运变成了一场灾难。
当他离任后回到离华盛顿不远的弗吉尼亚州蒙蒂塞洛山顶庄园时，他担心人们会怎样看待他的历史遗产和声誉。
禁运似乎没有使形势发生什么变化。
禁运取消后，英国人继续在海上搜查美国船舶，还扣留美国海员。
据估计，到1810年时，已有将近15万美国人被迫在英国舰船上服役。
禁运刚取消时，英国曾许诺让美国船舶自由航行，但实际上他们依然横行霸道，肆无忌惮。
麦迪逊1809年就任总统后，曾竭力争取扭转这一状况，但英国欺人太甚，美国公众坚决要求一战。
麦迪逊迫不得已，于1812年对英国宣战。
1814年夏季，英军攻入华盛顿，放火烧了白宫。
幸好这时来了一场暴雨，才没有全市焚毁。
当时已71岁的杰斐逊从自己家中就见到了那场大火。
但最后美军扭转了战局，迫使英军同意停战。
能有这样的结局，也该归功于杰斐逊早先没有宣战而是实行禁运。
这就让美国争取到几年时间加强军事力量，至少是最终挡住了英军的进攻。
杰斐逊有勇气坚持他的行动方针，这也许拯救了美国的自由。
杰斐逊在那场战争结束后又活了10年。
他一手创建了弗吉尼亚大学，他认为那是他留给后人的最后遗产。
他的墓碑上刻着他自己拟定的铭文：这里安葬着托马斯·杰斐逊，《独立宣言》起草人，弗吉尼亚宗教自由法令拟稿人和弗吉尼亚大学之父。
这里有意未提到他的一系列其他成就，包括他当过总统，更未提及禁运了。
1826年7月4日午夜，已生命垂危的杰斐逊问医生：今天是4号吗?医生说是的，杰斐逊哼了一声啊。
他让仆人们进来，说了再见，就瞑目了。
这时正是美国独立50周年。
附录托马斯·杰斐逊总统 1808年11月8日第八年度致国会咨文（节译）致合众国参议院和众议院：同胞们，倘若我们从欧洲得到的最后信息使我能够通知大家说，那些无视中立国权利因而给我们的商贸造成了如此重大损失的欧洲交战国，已经醒悟到它们有责任撤销它们那些错误的法令，那该令人何等欣慰。
我们自当不遗余力以争取此种可喜结果，为此，我已及时通过立法规定了全部或部分地暂停实施若干禁运法的权限。
我们驻伦敦和巴黎的公使已奉令各自向驻在国政府说明我们愿意行使这一权限，以便取消它们的侵略行为的借口，重开各方均认为已经受阻的商务往来……这一坦诚而又开明的实验迄今为止未能取得成功，也没有别的事态可作为暂停禁运的根据，因此禁运必然需要照原样保持。
然而令人满意的是，由于实施了已得到同胞们以爱国之情普遍予以支持的禁运措施，现已收到重要效果，即保护了我们的海员和巨额商货，并提供了时间来实行现时所需要的加强防务等措施……我们与我国驻伦敦和巴黎的公使来往信函文件已印发给诸位。
在国会上次会议期间所提交的文件已说明英国一艘兵舰袭击我切萨皮克号快船一事引起我国民义愤填膺的情形。
种种见解均令人相信英国政府应立即采取措施纠正这一错误行径……但迄今未见它采取任何措施……我们已指示驻伦敦公使就此事进行交涉，必要时要求对方做出赔偿，相关信函请见所提交的文件。
自从上次国会会议以来，我们与欧洲其他各国的关系无重大变化。
与西班牙的谈判时断时续，近来由于该国内政危机而陷于停顿。
我们与北非巴巴里沿岸诸邦继续保持和睦，惟一例外情况是阿尔及尔执政者对我驻当地领事有过无理行为，其性质和情况，请见所提交的文件，诸位可据此判断现时或今后是否需要采取超出行政权限范围以外的行动。
我们与印第安人邻居仍保持平静。
个别不端行为则一如既往时有发生……国会上次会议为保障海港城镇和港湾安全而拨款以后，有一些地点已依照其所处情况、相对重要性以及拨款量所能允许的工程规模，构筑防御工事。
除纽约和新奥尔良工程浩大尚需时日以外，其余各地工程大多将于本次会议期间完成。
上次拨款很大部分已用于原有地点的工程，但还将由国会审议另有哪些地方需要保证安全，防范海上袭击……关于去年12月国会批准建造的炮艇，现估计本年度只需要建造103艘。
这一些，加上原有的，已足以用于港湾和暴露的水域。
其余的少量炮艇一旦必要时即可于很短时间内造出来。