现今的孔庙呈长方形，南北长1120米，总占地约为3275亩，共有五殿、一祠、一阁、一坛、两堂、十七碑亭、五十三门坊，以中轴线贯穿，左右对称，布局严谨。
孔庙建筑共有九进院落，除了棂星门、大中门、圣时门、弘道门、同文门、奎文阁等建筑外，余下的建筑可分为三路，中路有大成门、大成殿、杏坛、寝殿、圣迹殿等，为祭祀孔子的场所；东路有崇圣门、崇圣祠、诗礼堂、家庙、故井、鲁壁等，为祭祀孔子上五代祖先的地方；西路有启圣门、启圣王殿、金丝堂和寝殿等，是专门用来祭祀孔子父母的地方。
来到孔庙，第一道门叫棂星门，也就是孔庙的大门，之所以叫棂星门，是因为棂星在古代的传说中是天上的文星，用此名有国家人才辈出的意思。
据史书记载，孔庙的棂星门始建于清乾隆十九年（公元1754年），有六楹四柱，为铁梁石柱，柱的顶端立有四尊天将石像，柱的下方为石鼓抱夹，给人以稳重端庄之感。
孔庙的二门叫做圣时门，有三间门洞，飞檐斗拱，顶为绿琉璃瓦，建于明代。
门洞前后的石陛御道上有明代浮雕——二龙戏珠，图中的游龙喷云吐雾，翻江倒海，栩栩如生，气势不凡。
门前的汉白玉坊叫做太和元气坊，用来赞扬孔子如天地一般无所不包。
门的东西两侧各有一座木坊，上边置有牌楼，形制相同，均为密集的斗拱，起翘的檐翼，几根柱子上透雕着狮子和天禄像等，造型极为古朴、生动。
孔庙的中部是奎文阁，属于藏书的楼阁。
由于奎星是中国古代的二十八宿之一，专门负责文章，所以将藏书楼命名为奎文阁。
此阁始建于宋朝的天禧二年（公元1018年），明成化十九年（公元1483年）进行了改建。
奎文阁长30米，宽1762米，高2335米，面阔七间，进深五间，为三重飞檐，四层斗拱。
奎文阁的内部有二层阁，中间设有暗层，上层是专门收藏历代帝王御赐经书、墨迹的场所。
明清年间曾设有奎文阁七品典籍官，以便对此进行管理。
阁中的暗层中用来收藏经版，下层专门收藏历代帝王祭孔时所需的物品。
这座藏书楼为木质结构，结构独特、工艺奇巧，堪称中国著名的木质楼阁之一。
杏坛坐落在大成殿前的院落正中，据说是孔子讲学的地方，北宋天圣二年（公元1024年）正式建坛，并在坛的周围种植了大量杏树，因此命名为杏坛。
金代时开始在坛上修建小亭，党怀英（公元1134—1211年，字世杰，号竹溪，今陕西省大荔人，金代书法家，工篆籀、隶书，官至翰林学旨承旨）篆书的杏坛二字石碑就立在亭上。
明隆庆三年（公元1569年），杏坛重修，亭上重檐，四面歇山顶，黄瓦飞檐，双重斗拱。
亭内彩绘金龙，雕刻精细。
亭四周的杏树繁茂，生机盎然，景色宜人。
孔庙的主体建筑应该是大成殿，此殿面阔九间，进深五间，长约54米，高约32米，深约34米，重檐九脊，黄瓦飞彩，有石柱28根，柱上浅雕云龙纹，雕梁画栋，巍峨壮丽。
大殿内高高悬挂着万世师表等十方巨匾、三副楹联，这些都是清朝乾隆皇帝的手书。
大殿的正中供奉着孔子的塑像，两旁是72个弟子和儒家历代先贤的塑像。
历朝历代皇帝的祭孔活动均在此大殿中举行。
三、孔林孔林又叫至圣林，位于曲阜城北2公里处，是孔子及其后裔的家族墓地，共有坟冢10余万座，周围环以高墙，林内有众多枝繁叶茂的松柏。
据史书记载，孔林修建于鲁哀公十六年（公元前479年），是孔子的弟子在孔子去世后将其埋葬在此处的。
后来，随着孔子地位的日益提高，孔氏附葬者也日益增多，孔林的规模自然也逐渐扩大。