孟庙内还生长着各种古木，有柏、桧、古槐、银杏和紫藤等。
这些树木大多栽种于宋、元时期，虽然距今已有近千年的历史，仍然青翠翁郁、森然茂盛。
此外，在众多古树中还有藤系银杏、古柏抱槐、桧寓枸杞、洞槐望月等四大自然奇观。
藤系银杏在孟庙斋戒门内，银杏树已有700余年的历史，至今绿荫蔽满整个庭院。
银杏树下有一株枝干粗壮、直径约40厘米的百年紫藤萝缠绕着它，一直伸展到树顶。
每年的四五月间，紫藤结出串串花穗，如紫玉串串，煞是喜人。
古柏抱槐在知言门外，已有700余年的树龄，树干周径约46米，树干中心从根部起长出一株巨槐。
两树的树干合为一体、连理缠绵，枝叶则青葱茂密，是国内罕有的双树寄生景观。
桧寓枸杞在孟庙寝殿前的露台上，为北宋宣和年间栽种，距今已有900多年的历史，是孟庙内最为古老的树木之一。
桧树枝叶青翠蓊郁、茁壮茂盛，连树干上鸟洞中寄生的数株枸杞也枝繁叶茂。
夏秋季节，绿叶衬托着红红的果实，妙趣横生。
洞槐望月在孟庙寝殿西侧的西垣墙上，据说种植于唐代，树干直径约6米，虽然主干现今已经枯朽，支干却长得高大茂盛，而且中空的主干上有直径约1米的圆洞，明月当空时月光就会从洞中透出，颇富古雅奇趣。
孟庙中的古树奇观历来受到人们的称赞，明代大书画家董其昌在《题孟庙古桧一首》诗写道：爱此孟祠树，森然见典刑。
沃根洙水润，含气峄山灵。
阅世磨秦籀，参天结鲁青。
方知樗散寿，只入列仙经。
孟庙内除了众多造型各异的古树外，还保存着秦、汉、晋、唐、宋、元、明、清等历朝历代的碑碣280余块，主要是历代皇帝的封赠圣旨、孟氏家族谱系、文人墨客的诗词赞颂、维修扩建纪实等，有隶、行、楷、篆等众多字体，具有极高的书法研究价值。
其中最为主要的碑刻有西汉《莱子侯刻石》、《秦峄山刻石》；东汉《石墙村刻石》；元代《封赠孟子为邹国亚圣公》圣旨碑；明《孟氏宗传祖图》碑等。
此外，孟母殿（孟庙的东北隅）的殿前立有一块石碑，上面刻着母教一人四个大字，体现了孟母教子有方的高尚品德。
三、孟林据传说：孟子的诞辰是农历四月初二。
为了纪念孟子，邹城的百姓每年农历四月初二至初五间，都前往孟林举行盛大的聚会。
届时，百姓们从四面八方蜂拥而至，既来朝圣，又将其作为集市，场面之热闹，无法用熙熙攘攘来形容。
这种集会虽历经数百年，仍经久不衰。
孟林神道孟林又称亚圣林，位于邹城东北125公里的四基山西南麓，是埋葬孟子及其后裔的墓地，因位于孟母林的东侧，所以又叫东孟林。
据史书记载：孟林始建于北宋景四年（1037年），在元、明、清年间多次进行扩建增修，如今占地约50万平方米，是国内现存规模宏大、历史最为悠久的家族墓地之一。
孟林依山傍水，林内古木参天，有柏、桧、榆、楷、柞、杨、槐、楸、枫等各类树木2万余株。
在众多树木的环绕下，一条长约3华里的神道直通孟林深处。
顺着神道前行，途中有一条小溪，一座拱形的单孔石桥横跨小溪两岸，名曰御桥，是当年皇上专为祭祀孟子修建的。
桥的左侧立有高大的石碑，上面写着亚圣林三个大字。
过桥前行，便可来到享殿大门。
在古代，享殿是帝王陵寝内供祭祀用的殿宇和帝王祀天祀祖的殿堂。
享殿在孟子的墓前，代表尊敬圣贤如同尊敬帝王。
据史书记载：孟林中的享殿原为三间，建于宋代，后期曾进行过修缮扩建。
据县志记载：明嘉靖四十一年（1562年），邹县令章时鸾创建正殿五楹，左右厢房各三楹，二门三楹，奠置有案，出入有阶，启闭有户，周围有垣，备极坚征，视前制益为广阔……现在的享殿为五间，高大宽敞，单檐斗拱，彩绘有多种图案，造型极其古朴，为清代修建，承袭了明代的建筑风格。