这场后世史家称之为宫之焚的大火，整整烧了一天一夜还多。
子末丑初，第一个火头自御车寄冒起；直到次日卯初，整个御所的大火才完全熄灭。
精美恢弘的御所一片焦黑，到处残垣断壁，再也找不到一间完好的房屋。
士兵们一边搬开断梁残瓦，搜寻尸体和可能的生还者，一边往废墟上浇水，防止死火复燃。
御所中，处处余烟袅袅，时时水汽弥漫，和刺鼻的焦臭一起，共同构成了一副诡异的有味道的画面。
太阳升起来了，光柱在烟雾和水汽中穿行，人影晃动，却没有人高声说话，火灾现场笼罩着一种令人不安的寂静，使得这幅画面显得愈加鬼魅。
一具具尸体被摆在已经变黑了的白沙地上。
这些尸体，有的已经焦烂扭曲，面目全不可辨；也有的是死于浓烟窒息，形状尚算完整。
情形愈来愈不对劲。
寻找尸体和生还者的工作已经进行了大半，但不论是死是活，迄今没有找到一个宫内的真正重要的人物：今上天皇；孝明天皇的异母妹妹敏宫；孝明天皇的遗孀们，女御——皇后九条御子，典侍——妃嫔，包括今上天皇的生母中山庆子，还有两位在和宫下嫁中发挥重要作用、曾经名列四奸二嫔的堀河纪子、金城重子——前者的另一个身份是岩仓具视的姐姐，后者的另一个身份是千种有父的妹妹。
这些人，统统不知下落。
不能完全排除有人烧得面目形状不能辨认——但这种可能性很低。
因为火头是从西边的御车寄烧起的，由西而东，再而北，这才烧到天皇居住的常御殿，最后才烧到先帝的皇后、妃嫔们居住的地方。
以上人士，应该有足够的时间逃生，一个都没逃出来，绝无是理。
当然，也可能全部都逃了出去。
火头既然由西而东，再而北，如果要逃生，自然是向东、向北，而萨摩藩守卫的乾门，就在东北方向。
萨摩藩一口咬定：这些大人物，俺们一个也没有看见。
更加不对劲的是，倒幕派那几位最重要的公卿，如中御门经之、中山忠能、岩仓具视、千种有父，迄今不见踪影。
幕府派人上门查问，几家人都是相同的说法：前天傍晚，宫里来人将老爷传走了。
最有意思的是：同时传进宫去的，还有几位大人的世子。
情形愈来愈清楚了：这是火遁啊。
乾门虽说由萨摩藩掌握，但幕府的探子和新选组一样在暗处施以严密监视。
正常情况下，不管白天黑夜，几十至百来号人，加上必不可少的辎重，从容出宫而不被发现，没有任何可能。
但御所大火，幕府和会津藩的注意力被火势吸引，精力完全放在灭火上面，加上其时的局面混乱无比，此时在夜幕掩护之下，趁乱出宫，最是神不知、鬼不觉。
而且，大火继续燃烧，整整又烧了一天一夜。
于是，在被发现人不见了之前，逃亡者们就有了足足一天一夜的宝贵时间，消除踪迹，远离追兵。
清君侧的口号嚷得太凶了，居然把瓮中之鳖吓跑了！瓮中之鳖？唉，想当然耳！人家其实原本就不在自己的瓮中啊。
萨摩藩和倒幕派勾起手来搞鬼无疑，说什么第三次请辞若还不获准，就自行撤离乾门，还假惺惺地和会津藩约定交接防务，戏演得真好！想到被人摆弄于股掌之上，松平容保气炸了肺。
可又能够怎样？扑上去咬人家？萨摩藩声称，天皇陛下下落不明，御所又变成了这副样子，俺们在京都也没啥事可干了，这就自行撤离——不过晚了一天而已，可别说俺们食言啊。
幕府顾不上萨摩藩了，现在的当务之急，是要把天皇追回来，不然，还不天下大乱？现在的京都，已经开始乱了。