面对朝廷的凶狠之势，农民军又是如何应对呢?杀入河南的农民军，到处出击。
一部自河南府的嵩县(今嵩县)杀到汝宁府的郏县(今郏县)，再进入开封府的禹县(今禹县)，围攻密县，后又放弃，撤围而去。
进入汝宁府的农民军，围攻信阳州城失利后，又退而南下，攻湖广的孝感、应山。
蝎子块的农民军数万人围攻颍州，大败官军于瓦店集，俘虏总兵张全昌。
然后挥兵南下，一路杀到湖广境内的蕲、黄地区，经宿松进犯南直隶安庆府境，进攻潜山、太湖。
另一支部队则杀入庐州府，犯英山、霍山，进扰舒城。
张献忠部似乎留在了河南西部地区。
留在陕西的高迎祥、李自成部也东西出击。
高迎祥率部西掠，进攻武功、扶风，围扶风城1个月而未下，明援兵至，主动撤出。
李自成则东击，攻富平、三原以东。
十月，李自成与官军总兵左光先、王世钦和副将曹变蛟大战于高陵。
此间，李自成部发生了一点小插曲，给李自成惹下了麻烦。
当官军与李自成部在醴泉相持时，李自成手下的得力干将高杰，竟投降了官军。
据说，高杰也是米脂人，深得李自成宠信。
而李自成妻邢氏则骄武多智，掌军资，负责分支粮仗。
不想日久生情，两人私通。
至此，高杰担心事情败露，难逃劫运，便挟持邢氏叛降官军，给李自成带来了不少麻烦。
高杰之叛，使洪承畴大喜过望。
洪承畴亲自追剿李自成，大战于渭南、临潼。
李自成屡败之后，向东撤逃。
此时高迎祥也受官军压迫，不断东撤，经华阴山中，与李自成会合。
然后合力东击，攻破河南卢氏县境内的朱阳关，于十一月份与张献忠等部合营于灵宝。
不过，也有人说，李自成根本就没出过陕西。
合营诸部随即猛攻阌乡，击败左良玉、祖宽部，进而攻陷陕州，并东击洛阳。
河南巡抚陈必谦率左良玉立即增援洛阳。
攻城受阻的农民军放弃洛阳，分兵进击。
张献忠部南犯汝州府，至嵩山、九阜山，被总兵祖宽击败，死亡千余人。
张献忠率部撤走。
朝廷称之为汝西大捷。
高迎祥等则走偃师、巩县，被从汝宁赶来的祖宽大败于白沙、龙门。
这支部队便南下汝宁府，围新蔡，攻遂平、确山、光山，最后被总兵祖宽大败于确山。
卢象升曾于此年底给友人写了一封信，描述了闯王高迎祥部的一些情况。
他说：二个月来，奔命于汝、宛、河、洛之间，万分忙苦。
贼多而且横，前后俘斩虽有数千，但尚不是荡平胜著。
必须于崇祯九年正、二、三月内，先剿灭闯王一股，余贼方可次第歼散。
他接着介绍了闯王高迎祥一部的情况：闯王之贼大约七万余，妇女约一二万，丁壮约一二万，精骑约三四万。
此贼不亚安(安禄山)、史(史思明)，朝廷或许还没有详细了解。
此前曾在陕西与洪亨老(洪承畴)大战三次。
近来入豫，我与他也大战过两次，擒斩死伤逃散约两万人，至今尚存五万，依然是劲敌!卢象升还点出了他的担忧：其余五六股贼众，见剿兵渐集，纷纷与闯王合营，势力更大。
现在闯王诸部，合奔东南一带，楚、黄、凤、泗、淮、扬，十分危急。
因此，我正星驰而南。
卢象升的担心，不是多余的。
崇祯九年（1636）正月，闯王等部正向凤阳方向杀去。
闯王高迎祥在确山被击败后，有人说他曾一度回到陕西，开年后重新杀出。
更有人说李自成根本没有与高迎祥一起杀入河南，而是始终留在陕西。
意见很不统一。
现在看来，李自成是否与高迎祥一起杀到过河南，确实还有疑问，但高迎祥在崇祯八年（1635）十二月确山之败后，没有重回陕西，而是直杀东部，这大概可以确定。
确山之败后，与高迎祥一度合营的老回回、蝎子块曾杀回陕西，被洪承畴部击败于临潼，南入商洛山间。
或许是有人把这部分农民军误认为是高迎祥部了。
崇祯九年正月，闯王率部从河南汝宁府的固始、光山杀入南直隶境内，攻击庐州城(今合肥)，阎雄率边兵急救庐州。
农民军转而攻下巢县(今安徽巢县，属庐州府)、含山(今安徽含山，属和州)。
接着，农民军冒风雪攻占长江之北的和州(今和县)，杀知州黎弘业等。
一部分农民军沿江东击，攻打南京之北的江浦(今江苏江浦)。
南京兵部尚书范景文急派兵防御，农民军退却。
闯王、张献忠等7家数十万人则联营攻打滁州。
滁州知州刘大巩拼死固守，城防危在旦夕。
卢象升闻警后，立即率总兵祖宽、游击罗岱、副将李明辅等飞驰滁州城下，与农民军展开激战。
最后，农民军被击溃，尸伏无数，滁河水赤流数里。
吃了大亏的农民军急速向凤阳、寿州方向撤退。
官兵沿路邀击，农民军损失惨重，开始分路向河南境内溃退。
卢象升急速追入河南，布置各军围剿，一时河南境内，杀声震天，血肉横飞。
农民军最后逃入南阳府的内乡、淅川山中，卢象升奈何不得。
至此年三月，闯王等又纷纷杀回陕西。
围剿的中心一下子又回到了陕西。
朝廷起用孙传庭任陕西巡抚。
孙传庭出任巡抚后，锐意进攻。
其副将罗尚文击杀整齐王于商洛山中。
五月，贺人龙又于安定大败李自成部。
六月，总兵祖宽等率精锐边兵进入陕西作战。
七月，孙传庭、洪承畴率部追击闯王高迎祥于盩屋(今周至)，双方展开激战。
后因部下叛变，高迎祥被俘，被送往京师，寸磔而死。
高迎祥之死，对陕西的局势产生了很大影响。
不久，农民军首领张妙手、蝎子块向朝廷投降。
李自成部也在崇祯九年九月在汉中失利后，杀入四川，至崇祯十一年（1638）初才重回陕西。
但不久李自成部连遭败绩，于此年八月重新躲入川、陕、湖广3省交界的山区，直到崇祯十三年（1640）冬才突然杀出，进入河南。
活跃于河南、湖广、安徽地区的张献忠等部，至崇祯十年底（1637）也遇到了困难。
崇祯十二年（1639）初，张献忠在湖北谷城接受朝廷的招抚。
射塌天、罗汝才、混十万、整十万、十反王、托天王、小秦王、过天星、紫微星、一字王等纷纷投降。
此年五月，张献忠、罗汝才又重新反叛。
李自成也于崇祯十三年（1640）冬钻出山区，重新发展，直到最后掀翻明朝。
有关李自成、张献忠的详情，将留在后面叙述。
这里先说说崇祯帝即位近10年来，大明朝为何弄成这种局面。