没想刘宗周并没有到此为止。
一个月后，刘宗周竟又上了那篇有名的《痛恨时艰疏》，其措词之激烈，可以说是前所未有。
他竟敢指责崇祯帝不懂圣王求治之道，所作所为不得要领。
接着，他又要求崇祯帝不要轻改成法，当以简要出政令，以宽大养人才，以忠厚培国脉，发政施仁，收天下之心等等。
言下之意，就是崇祯帝在这方面做得不够。
崇祯帝看到奏疏后，开始是怒不可遏，决意严惩。
最后他虽放过了刘宗周，但心中已生厌恶之意。
此年十月，当刘宗周再次上疏，指责皇帝重用宦官及内阁无能时，崇祯帝便再也无法忍受了。
刘宗周终于被罢免。
到崇祯十五年（1642），被崇祯帝认为是清正敢言却无用的刘宗周，再次被起用为左都御史。
没想到上任不久的刘宗周，又与崇祯帝顶撞起来，再次丢了官。
当时，给事中姜埰、行人司副熊开元因得罪了崇祯帝，被下了诏狱，密旨拟处死。
刘宗周则认为言官以言语获罪而被下诏狱，本朝尚无先例，也有伤国体，于是便联络群臣奋起救援。
在崇祯帝召对群臣时，刘宗周与崇祯帝针锋相对，据理力争。
结果是姜、熊二人保住了性命，刘宗周却再次被罢免。
黄道周，福建漳浦人，天启二年（1622）进士，曾以翰林院编修的身份，任皇帝经筵展书官，后因与魏忠贤有矛盾而致仕闲居。
崇祯二年（1629），黄道周被重新起用。
崇祯五年（1632），黄道周因上疏攻击周延儒、温体仁而被崇祯帝解职。
崇祯九年（1636），黄道周再次被起用。
至崇祯十一年（1638）六月，当时已是日讲官、少詹事的黄道周，与杨嗣昌等一起被廷推为阁臣，由崇祯帝作最后定夺。
崇祯帝圈定杨嗣昌等人入阁，却把呼声很高的黄道周排除在外，颇出人意料。
不久，黄道周便连上3疏，分别攻击杨嗣昌夺情恋位、陈新甲(原为逆案中人，由杨嗣昌重新起用)走邪径、辽东巡抚方一藻主和议等，措辞相当激烈。
崇祯帝则认为，黄道周此举，是与他未能入阁有关。
于是，崇祯帝便把他下到吏部，由吏部议其外遣。
不过，崇祯帝在不久后召见内阁及部院大臣时，又与黄道周发生了激烈冲突，从中不难看出崇祯帝对清流的心态。
当时崇祯帝责问黄道周说：凡无所为而为者，谓之天理；有所为而为者，谓之人欲。
你的三个奏疏是在你廷推不成（没有入阁）后上的，这能说是无所为吗?崇祯帝的意思很明确，就是说你黄道周上此3疏，是有所为而为者，目的就是为了表达你未能入阁之怨气。
没想到黄道周立即反驳道：天、人止是义、利，臣心为国家，不为功名，自信是无所为!崇祯帝反问道：上个月陈新甲被起用时，你为什么不讲?黄道周随口就说：当时御史林兰友、给事何楷都已上疏弹劾，我与他们是同乡，担心涉结党嫌疑。
崇祯帝反唇相讥：难道现在就无嫌疑?黄道周接着便说：天下纲常，边疆大计，今天不讲，后面就无机会，并不是出于私心。
至此，崇祯帝已不想再与他争下去，便教训道：清固美德，但也不可过分。
未料黄道周仍不依不饶，把矛头直指杨嗣昌，说他是不孝不悌。
杨嗣昌正在走红，哪里能忍受这种言语，便愤而出奏，称自己是先国后家，并反过来指责黄道周说：你黄道周的道德学问，本人向来钦佩，而你却自称不如郑鄤，还谈什么纲常伦理!杨嗣昌的原意，也并不是说黄道周不如郑鄤，而是说你黄道周人品学问，都到了为人宗师的分上，却仍说不如郑鄤，那么你那套纲常伦理还有什么谈头？郑鄤何许人也?郑鄤，武进横林人，其父郑振先、叔父郑振光都是进士，外祖父是大学士吴区闻，岳父是大宗伯孙淇澳。
他本人18岁中举人，28岁中进士，选庶常，揭大珰，一时名气峻峭而鸿远。
他的后母，是大学士吴宗达的妹妹，性格暴烈，经常虐待奴婢。
郑鄤实在看不下去，便求助迷信，整治了她一下。
这就是所谓的郑鄤杖母事件。
此事后由吴宗达向朝廷揭发，没想到却被温体仁利用，并以此来攻击郑鄤的好友、大学士文震孟。
崇祯八年（1635）十一月，郑鄤被下了诏狱，至崇祯十二年（1639）被凌迟处死于北京。
黄道周曾与郑鄤交游，并说过自己的文章不如郑鄤，以示谦虚。
没想到此时被杨嗣昌抓住把柄。
听杨嗣昌这么一说，崇祯帝记起了此事，便责问黄道周：古人之心无所为，今见各有所主，故孟子欲正人心，息邪说。
古之邪说，别为一教，今则直附于圣贤经传中，系世道人心更大。
你还说自己不如郑鄤，是何道理?黄道周反驳道：我说的是文章不如郑鄤!崇祯帝穷追不放，黄道周则理直气壮，针锋相对，坚持说杨嗣昌、陈新甲不对。
崇祯帝最后竟举出少正卯被诛之事，来影射黄道周。
黄道周大声抗辩：少正卯心术不正，臣心正无一毫私。
两人顶到这种分上，都有点下不了台。
崇祯帝大怒之下，叱之退下，候旨发落，哪里会料到黄道周会大声争辩道：臣今日不尽言，臣负陛下；陛下今日杀臣，陛下负臣!崇祯帝听罢此话，也盛怒之极，竟挖苦道：尔一生学问，止成佞耳!黄道周一听皇帝竟说他奸佞不正，便跪下抗辩道：臣敢将忠佞两字给皇上剖析清楚。
如果在君父面前，独立敢言算是佞的话，那么在君父面前谗谄而谀岂不是忠?!忠佞不别，邪正混淆，何以致治?崇祯帝再次喝令黄道周退下。
最后，崇祯帝将黄道周连贬六秩，外放江西。
崇祯十三年（1640），余怒未消的崇祯帝，又将黄道周及举荐黄道周的江西巡抚解学龙，以党邪乱政、徇私的罪名，一起逮至京师，杖打80，并下了刑部狱，并重罚了那些试图为黄道周辩解的官员。
刘宗周、黄道周等人，都是当时著名的清流，学问道德，为天下共推。
他们的言行，或许过于激烈，有时甚至很是迂腐，但他们的忠直、负责精神，正是当时官场上所缺乏的。
如能用好这些人，则不仅为文官集团提供了榜样，更能鼓舞人心，激励正气。
更何况他们所提出的许多观点，正切中时弊，如能依此而行，于朝廷当大有裨益。
平心而论，崇祯帝也知道刘宗周、黄道周等是操守、学识俱佳之臣，也希望能重用他们，能帮他力挽狂澜。
但君臣之间，最终不仅未能和谐相处，同舟共济，反而弄到这般田地。
究其原因，固然有双方性格、观点方面的因素，但最根本的症结仍是崇祯帝的治国之策。